龙朔二年的八月，高宗任命许敬宗为太子少师、同东西台三品、知西台事。十月，上官仪也被高宗任命为同东西台三品。很明显，许敬宗策立武后有功，又是太子少师，绝对是会偏向皇后的。与之相比，上官仪则完全听命于高宗。这也应该正是高宗的目的：监国的太子年幼，亲近太子的大臣不免倒向太子之母，而这样的人事安排，总的来说，使这时的唐王朝诸相，无论各自偏向哪一方，力量对比之后仍然使皇帝的权力毫不动摇。然而随着左相许圉师被贬、完全倒向武皇后的李义府荣升右相，事情就发生了变化，不用想都知道，上官仪置身于许敬宗和李义府之间是个什么光景。谁知就在龙朔三年李义府就垮了台，而由于此一事件的发生，帝后之间自然也不可避免地出现了一些裂痕。高宗开始觉得皇后不如从前那般柔顺，心里颇忿然。这情形自然也看在周围人的眼里。于是事情就发生了。
有个叫郭行真的道士曾经出入宫禁，据说他法术高强，还曾经为武皇后效命，施行过厌胜之术。结果就被宦官王伏胜给告发到了高宗面前。
史书上并没有明确记载过郭行真的厌胜术是针对何人何事所施，从后面发生的事来看，应该也并不要紧。但是无论如何，此术在历代皇宫都是绝对的禁忌，高宗闻讯后也果然大怒，决定要给皇后一点颜色看看。于是他秘密召来了上官仪，与他商议处理方案。上官仪趁机进言道：“皇后专恣，海内所不与，请废之。”高宗也觉得言之有理，就让上官仪当场草拟废后诏。而这整个过程，都被殿内外的宫人宦官们听了个满怀。眼看皇后将要被废，众人都是大惊失色，飞快地跑着去给武皇后报讯。
武媚做昭仪时，就在后宫中广结善缘，宫女宦官多在她的笼络中，并多次为她提供王皇后萧淑妃等人的不当言行；如今她做了皇后，回想王皇后前尘，当然更要将此一网络继续发扬光大并让它仍为自己服务。以武媚的本意，恐怕只不过是想随时掌握皇帝的去向，避免“武媚第二”出现，万万没有料到如今竟有意外收获，宫人带给自己的居然是这样一条天大的情报。
又惊又怒的武皇后立即赶往现场，果然及时“人赃俱获”：废后诏的草稿还没来得及送往中书省，尚在皇帝的书桌上。俗语说“见面三分情”，高宗当年与王皇后未育儿女，恩情有限，又对其杀女之事深信不疑，在王氏被废后还不免要眷念旧情，何况如今面对儿女成群恩爱殊深的武皇后？眼看武后涕泪交流地为自己辩解，高宗又羞又愧，哪里还忍心说个不字？不但立即后悔起来，还迅速重拾恩爱，自动消弭了心中对武后的嫌隙。
床头打架床尾和。帝后间夫妻恩爱重燃，上官仪立马就成了“外人”。高宗见皇后哭哭啼啼不是好光景，唯恐老婆日后追究责任，说自己没有情义，到时阃政猛于虎可不是那么好受的。于是眼珠子一转，把上官仪甩了出来当替罪羊哄老婆道：“我哪里舍得废了你呢？这全是上官仪的主意，是他教我这么做的，我不过是一时糊涂。”
上官仪恐怕做梦都没有想到，堂堂的天朝上国之君，居然会当场翻供。——其实他也应该想得通：自己虽是宰相，对皇帝来说也只不过就是一个臣下仆从，皇后却是皇帝的妻子、太子的生母，拿一个奴仆的性命去讨好老婆，解脱自己，实在也不足为奇。上官仪这也算是为皇帝效了忠了。
高宗的责任推卸得十分干净，武后当然也不能跟老公一直过意不去，于是满腔的怨恨怒火就都转向了上官仪。在调查废后事件的过程中，武后迅速发现了上官仪和王伏胜有一个同样的履历：贞观末永徽初，高宗长子、废太子李忠封陈王，上官仪时任陈王府咨议，王伏胜同时为陈王府内侍。武后立即将上官仪和王伏胜的履历联想在了一起，又联想到了一直偷偷追悼柳奭与韩瑗，有“窥伺太子位”嫌疑的废太子李忠。历代宫廷事件使世人都知道一件事：皇后一旦被废，出自她腹中的皇太子的地位就会随之不保。上官仪身为宰相又岂有不知之理？在帝后生嫌隙的时候他不对皇帝劝阻以保太子，反而如此主动地提议废后；王伏胜在整个后宫（连皇帝左右在内）都忠于皇后（当然也包括皇后亲生儿女）的时候，偏偏要反其道行之告发皇后，其用意何在？（实话说，这联想还是很站得住脚的）。